В каком режиме работы программы? В режиме локальной библиотеки или при скачке с либруса?

В режиме локальной библиотеки такой проблемы нет. Если книга есть - она будет найдена. Единственное "но" - книга должна либо находиться в архиве (дейли, тысячники), либо в каталоге локальной библиотеки (по-умолчанию папка LIB). Если книга находится в архиве(дейли, тысячники) - нужно проверить, видятся ли другие книги из этого архива. Если нет - смотреть в настройках правильность путей к архивам локальной коллекции и правильность имени архива с книгами. Он должен иметь формат типа 123456-2345678.zip
Если книга в папке lib - тут формат имени может быть разный. Желательно, что-бы он либо начинался с букид либо имел формат типа 258479.fb2.zip или 257383.txt.zip. Нормально воспринимаются и имена книг, качавшихся майхомлибом.

В режиме онлайн-библиотеки подобная проблема может возникать в следующих случаях:
1. Книга требует определенного уровня доступа.
2. В. настройках не прописаны логин-пароль
3. Либрус глючит.
4. Проблемы с сетью.

а они точно есть в архиве? Если есть - какие именно имена (пару примеров, если можно с указанием букид) и ссылку на раздачу.

тяжело сказать не видя самих архивов

Да почему же ? Всё вполне нормально, нормальная рабочая ситуация. Если вина программы - будем искать и исправлять. Если вина раздачи - тут уже ой, разве-что придумать, как эти баги обойти.

112059 Oliver Jamie «Sainsburys Recipes»
113877 Китлер Мартина «Молочные напитки - несложно и вкусно»
113879 Зыкина Ольга «Острые салаты и пряные закуски по-корейски»
113880 Смирнова Любовь «Вкусные пудинги и запеканки»
113881 Сбитнева Евгения «Лучшие рецепты национальных кухонь»
113885 Смирнова Любовь «Самые вкусные салаты»
113957 Зыкина Ольга «Блюда в духовке»
113959 Китлер Мартина «Вафли – несложно и вкусно»
113960 Имхоф Сабина «Рулеты – несложно и вкусно»

И т.д. если надо, могу продолжить перечисление.
Группа KaiserTeam проделала колоссальный труд, стараясь сделать коллекцию наиболее полной и находя книги, которые программа не открывает, вроде как огорчаешь людей.

Да упаси боже... Просто я иногда скачиваю для теста именно то, что работать не хочет Да и жаловаться не надо, kaiser сам попросил меня зарегаться на торенте что бы отслеживать проблемы

- отсутствуют в архиве 112432-120530.zip из указанной раздачи напрочь...

скачал книгу Smirnova_Samyie_vkusnyie_salatyi.113885.pdf.zip, вкинул в папку LIB в каталоге программы - книга видится нормально.
скачал книгу Zyikina_Ostryie_salatyi_i_pryanyie_zakuski_po-koreyski.113879.pdf.zip, распаковал, пдф-файл и всунул в архив 112432-120530.zip (долго, правда перепаковывается) - открыло прекрасно. Естественно, второй способ не катит, если эти файлы стоят в раздаче торента.

Все перечисленные книги в архиве есть, они находятся в начале списка среди нераспакованных ZIP - WinRAR. Названия выглядят таким образом:
113877 Китлер Мартина «Молочные напитки - несложно и вкусно»
Martina_Kittler_Molochnyie_napitki-neslozhno_i_vkusno
113879 Зыкина Ольга «Острые салаты и пряные закуски по-корейски»
O_Zyikina_Ostryie_salatyi_i_pryanyie_zakuski_po-koreyski
113880 Смирнова Любовь «Вкусные пудинги и запеканки»
Lyubov_Smirnova_Vkusnyie_pudingi_i_zapekanki
113881 Сбитнева Евгения «Лучшие рецепты национальных кухонь»
Evgeniya_Sbitneva_Luchshie_retseptyi_natsionalnyih_kuhon
113885 Смирнова Любовь «Самые вкусные салаты»
Lyubov_Smirnova_Samyie_vkusnyie_salatyi
113957 Зыкина Ольга «Блюда в духовке»
O_Zyikina_Blyuda_v_duhovke
113959 Китлер Мартина «Вафли – несложно и вкусно»
Martina_Kittler_Vafli-neslozhno_i_vkusno
113960 Имхоф Сабина «Рулеты – несложно и вкусно»
Sabina_Imhof_Ruletyi-neslozhno_i_vkusno
Из указанных по ссылке http://book.libertorrent.com/viewtopic.php?p=23248#23248 176 не открывающихся книг, 135 точно есть в архивах. Могу сомневаться насчет 41 не найденной в архивах, хотя выходила в инет и сверяла инициалы и названия, но могла и проглядеть.
Что касается папки LIB, понравилось. Очень! И какой объём в неё можно вложить?
А вот с перепаковкой архива сложнее. Архив 112432-120530 в раздаче имеет 5,91 ГБ, а после того как разархивировала, вложила распакованные пдф и запаковала, получилось 5,68 ГБ. И теперь ни одну книгу из этого архива программа не видит. И что я делаю не так?

Есть подозрение, что эти имена хранятся в юникодовской кодировке, на которую зип просто не расчитан. Винраром они может и будут видны, но не зипом. Такие имена, как правило, представляют собой набор "кракозябр" типа +Вaw_P_+Вo+Дski_Czas_wodnika.fb2
При перепаковке обычным способом имена корежатся и восстановлению не подлежат. Для себя я вынужден был писать перепаковщик, который преобразует эти имена в нормальную кодировку. Программа библиотекаря самостоятельно преобразует эти имена в корректные, но в том случае, если архив был изначально сформирован в подобной кодировке (под линуксом) и не подвергался модификации.

Если бы ты знал что сменилось... Этот деятель полностью перемутил фб-2 файлы, добавив признаки конца строки после каждого тэга... В итоге все книги, качавшиеся ранее в тысячниках и дейли полностью не соответствуют заявленным размерам и хешам мд5 в базе!!! ЗАЧЕМ ???? Я уже не говорю, что многих книг в базе просто нет, хотя ранее они были и на либрусе есть и по сей день. Такое впечатление, что база умышленно деактуализируется... В связи с этим я временно притормозил работу над второй веткой, ибо пока не будет разработан антивандальный механизм сохранения данных - с подобными "нововведениями" библиотекарь теряет смысл. Получается большая куча книг без записей в базе

Ну, я думаю, из оставшихся кусков можно слепить боле-мене полную базу имеющихся книг. У меня сейчас задача умудриться используя полные дампы базы либруса выцеплять недостающую инфу не затрагивая уже имеющуюся. Как только идея оформится в коде - будет значительно проще.

ну, этому я не удивлен особо...

цель Ларина - полностью дискредитировать офлайн библиотеку... тихенько и без революций...